中国社会科学院研究生院经济系以中国社会科学院经济研究所为依托。中国社会科学院经济研究所的前身是1929年成立的中华教育文化基金会社会调查所。1934年社会调查所与中央研究院社会科学研究所合并，沿用社会科学研究所名称。1945年更名为中央研究院社会研究所。1949年新中国成立后，改称中国科学院社会研究所。1953年更名为中国科学院经济研究所，1977年始沿用现名。现在经济研究所已发展成为一个理论经济学、应用经济学和经济史学（包括经济史和经济思想史）三方面兼有，而以基本理论研究为主的综合性经济研究机构。编辑出版学术杂志《经济研究》、《经济学动态》、《中国经济史研究》。
按照国务院学位办的学科划分标准，经济系具有理论经济学一级学科博士学位授予权。博士招生范围包括政治经济学、经济思想史、经济史、西方经济学、发展经济学5个二级学科，硕士招生范围包括政治经济学、经济思想史、经济史、西方经济学、发展经济学，以及应用经济学学科的国民经济学6个二级学科。
经济系目前有博士生导师36名，硕士生导师44名；学部委员3人。现任经济系主任为经济研究所副所长、博士生导师杨春学教授。
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